RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 Q499Y3 187 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD8Q8NHS3 518 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM63Q969Q1 353 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP6Q96JE9 813 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 DERL3Q96Q80 235 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SDHAF3Q9NRP4 125 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0G2JMP0 313 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0X1KG70 313 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM212A6NML5 194 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPP3O14495 311 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ATF1P18846 271 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR9P51686 369 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 Q0VFX4 171 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPNQ5VXI9 398 aa22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR13C5Q8NGS8 318 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CREB3L1Q96BA8 519 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR14A2Q96R54 314 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MALT1Q9UDY8 824 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 B9D1Q9UPM9 204 aa22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 AIPO00170 330 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ORC5O43913 435 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFAND5O76080 213 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CRABP1P29762 137 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 GRPRP30550 384 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2NLQ5JXB2 153 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 BICRALQ6AI39 1079 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 YIPF7Q8N8F6 280 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AK2Q8NH90 309 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OTOSQ8NHW6 89 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf40Q8WUR7 153 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CRB3Q9BUF7 120 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NOX4Q9NPH5 578 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF9O43307 516 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFPL1O95159 310 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CALCBP10092 127 aa22.75■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 MMP28Q9H239 520 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT4Q9H2B2 425 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINI2O75830 405 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 ROM1Q03395 351 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ8Q15842 424 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 DNM1P34Q6PK57 102 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSSK2Q96PF2 358 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV7Q9Y603 341 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCTN6O00399 190 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PIN1P1O15428 100 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1B1O43704 296 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF254O75437 659 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MNDAP41218 407 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 GHDCQ8N2G8 530 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A8Q8TCC7 542 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GAL2Q96JF0 529 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8B4Q96RC9 309 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TTTY10Q9BZA0 68 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 COPZ2Q9P299 210 aa22.73■■□□□ 1.23
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