RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA2P17301 1181 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RHCEP18577 417 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FUT4P22083 530 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CCNOP22674 350 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CDAP32320 146 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 APLNRP35414 380 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HSPA13P48723 471 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A3P48764 834 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 HIST3H3Q16695 136 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ZBED5Q49AG3 693 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf89Q6UX73 402 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 OR52J3Q8NH60 311 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP13Q9UII6 198 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FZR1Q9UM11 496 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPW3 197 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 A6NIZ1 184 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 SELENOVP59797 346 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 RAP1AP62834 184 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 PRR20DP86480 221 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PRR20BP86481 221 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PRR20AP86496 221 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 APOFQ13790 326 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NRN1LQ496H8 165 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SATL1Q86VE3 508 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC8Q8TC99 324 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF75AQ96N20 296 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ALG12Q9BV10 488 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TPK1Q9H3S4 243 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.18□□□□□ -1.26
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