RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578527.1

PITPNC1-202, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PITPNC1, Length 1,735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNC1-202ENST00000578527 KIR3DL2P43630 455 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 CCR9P51686 369 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 MFAP5Q13361 173 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 CAMK2DQ13557 499 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 RTP5Q14D33 572 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF79Q15937 498 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 WDR38Q5JTN6 314 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 CEP78Q5JTW2 689 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 VASH2Q86V25 355 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TPRA1Q86W33 373 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TMEM123Q8N131 208 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 THEM6Q8WUY1 208 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 PHYHIPQ92561 330 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 AP3S1Q92572 193 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 MED12Q93074 2177 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TMEM54Q969K7 222 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 MCHR2Q969V1 340 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 SCMH1Q96GD3 660 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 C4orf45Q96LM5 186 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 RBP7Q96R05 134 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 OR14A2Q96R54 314 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 MED13Q9UHV7 2174 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 CMAHPQ9Y471 501 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.65□□□□□ -1.5
PITPNC1-202ENST00000578527 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF879B4DU55 563 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 LINC01387J3KSC0 135 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 NKX2-8O15522 239 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF254O75437 659 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 UPK1BO75841 260 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 SP1P08047 785 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 CELA3AP09093 270 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ZNF12P17014 697 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 LAP3P28838 519 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 LHX2P50458 406 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 RRADP55042 308 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 OR10A3P58181 314 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 CLRN1P58418 232 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 TOMM20Q15388 145 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 KCNMB1Q16558 191 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 C10orf128Q5T292 105 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 HBMQ6B0K9 141 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 C16orf87Q6PH81 154 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 Q6ZNX1 250 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 NSMAFQ92636 917 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 HAS2Q92819 552 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 SFXN2Q96NB2 322 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 DERL3Q96Q80 235 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 OR2M2Q96R28 347 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 GFI1Q99684 422 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 SOSTQ9BQB4 213 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 MROQ9BYG7 248 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.65□□□□□ -1.51
PITPNC1-202ENST00000578527 ABCB9Q9NP78 766 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms