RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF292	O60281	2723 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPL8	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		B4DXG7	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		J3QLW9	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC22A1	O15245	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	AIRE	O43918	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FZD7	O75084	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PTH	P01270	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SPARC	P09486	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CLU	P10909	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FCGR2A	P12318	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF19	P17023	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SHC1	P29353	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINB10	P48595	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RGS6	P49758	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CLDN20	P56880	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ADAM8	P78325	824 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	BDH1	Q02338	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GALE	Q14376	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TRAM1	Q15629	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	INA	Q16352	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DDO	Q99489	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	WDR76	Q9H967	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MED29	Q9NX70	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PTPRB	P23467	1997 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		K7ENP7	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SELENOF	O60613	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CYTIP	O60759	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINA3	P01011	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HRG	P04196	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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