RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PFN4	Q8NHR9	129 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC58	Q96CX6	371 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NTN4	Q9HB63	628 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NGF	P01138	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	MT-ND1	P03886	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ADH4	P08319	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	FUT1	P19526	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	FPR2	P25090	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PCGF2	P35227	344 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVK-25	P63136	954 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PSG4	Q00888	419 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXL1	Q12952	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NSMAF	Q92636	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CGREF1	Q99674	301 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXH1	O75593	365 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	OR7A10	O76100	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1CB	P62140	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CD47	Q08722	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SGCA	Q16586	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DOK3	Q7L591	496 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DPP10	Q8N608	796 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ICMT	O60725	284 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CD55	P08174	381 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	PRTN3	P24158	256 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	LAP3	P28838	519 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	GZMM	P51124	257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM27B	Q5VT28	67 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10A6	Q8NH74	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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