RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.77□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A1P53007 311 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 RTL8BQ17RB0 113 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CHST6Q9GZX3 395 aa7.76□□□□□ -1.17
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