RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	WRB	O00258	174 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DLGAP1	O14490	977 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH16	O75309	829 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR7A10	O76100	309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT14	P02533	472 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT6A	P02538	564 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FAS	P25445	335 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SHC1	P29353	583 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CALCR	P30988	508 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A1	P53007	311 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UCN	P55089	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CHRNB3	Q05901	458 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CD47	Q08722	323 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5I1	Q13606	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PON2	Q15165	354 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R7	Q15435	360 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR4	Q16378	134 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	AANAT	Q16613	207 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DGUOK	Q16854	277 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ITFG1	Q8TB96	612 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	STARD8	Q92502	1023 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PSME2	Q9UL46	239 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		K7N7A8	449 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LGI1	O95970	557 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPIND1	P05546	499 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-E	P13747	358 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF43	P17038	809 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TNNI1	P19237	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP1	P29972	269 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	GSS	P48637	474 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MYLK	Q15746	1914 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ING5	Q8WYH8	240 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PEX13	Q92968	403 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT74	Q96LB3	600 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TMCO1	Q9UM00	188 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA1E	Q15878	2313 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRD	P23468	1912 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SMCO2	A6NFE2	343 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		C9JVG2	144 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PSTPIP1	O43586	416 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CYTH3	O43739	400 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT1A9	O60656	530 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FTH1	P02794	183 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA13	P27216	316 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF1	P27539	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	VHL	P40337	213 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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