RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR35Q9HC97 309 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A14Q9HCY8 104 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 GLTPQ9NZD2 209 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CIB4A0PJX0 185 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 G3V2T6 193 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 H0YHG0 523 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 M0R1B8 84 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 M0R3G1 203 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 RAD51DO75771 328 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CSF3P09919 207 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 BMP4P12644 408 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF23P17027 643 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PRKACGP22612 351 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PAX7P23759 505 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CFPP27918 469 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PDLIM4P50479 330 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CLRN1P58418 232 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ERVK-25P63136 954 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 GABRA6Q16445 453 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 THEM4Q5T1C6 240 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CARD17Q5XLA6 110 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 FAHD1Q6P587 224 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF627Q7L945 461 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ADCK1Q86TW2 530 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PARP8Q8N3A8 854 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 STMN2Q93045 179 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 RADILQ96JH8 1075 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 SAMD8Q96LT4 415 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 Q96M85 177 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF570Q96NI8 536 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 SNX18Q96RF0 628 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PKP2Q99959 881 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CRLF2Q9HC73 371 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS37A4D1T9 235 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5H1A6NKK0 313 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 BHLHE40O14503 412 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 XKRYO14609 159 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 DHHO43323 396 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNAB3O43448 404 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 MGRN1O60291 552 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 QDPRP09417 244 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OSMP13725 252 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 DAPP51397 102 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 EFNA4P52798 201 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CR1LQ2VPA4 569 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 NRN1LQ496H8 165 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 MESTQ5EB52 335 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf128Q5T292 105 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 LNX2Q8N448 690 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2T33Q8NG76 320 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms