RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF627Q7L945 461 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 LNX2Q8N448 690 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 MFSD4AQ8N468 514 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 SYT14Q8NB59 555 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 MCHR2Q969V1 340 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 CIB1Q99828 191 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ADI1Q9BV57 179 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 IFT27Q9BW83 186 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 NELFAQ9H3P2 528 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 DLGAP1O14490 977 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT33AO76009 404 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 THBDP07204 575 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 QDPRP09417 244 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 CLRN1P58418 232 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf128Q5T292 105 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC01560Q8TB33 94 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM63Q969Q1 353 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 S100PBPQ96BU1 408 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 USE1Q9NZ43 259 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.16□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 PRSS37A4D1T9 235 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 SOCS2O14508 198 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ARHGEF9O43307 516 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 DHHO43323 396 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 RAD23AP54725 363 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 CDK5Q00535 292 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 FMODQ06828 376 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 NEDD8Q15843 81 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR31Q8NA23 367 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.15□□□□□ -0.62
RPUSD4-208ENST00000533628 ISPDA4D126 451 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 H7C1C5 153 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 CCRL2O00421 344 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 RAD51DO75771 328 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ALPLP05186 524 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP3CBP16298 524 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 IL32P24001 234 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 GIPRP48546 466 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 LCN6P62502 163 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 THEM4Q5T1C6 240 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF773Q6PK81 442 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ADCK1Q86TW2 530 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2T33Q8NG76 320 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 COQ7Q99807 217 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 C8orf4Q9NR00 106 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.15□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5H1A6NKK0 313 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC2A10O95528 541 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 EPHA2P29317 976 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 CRISP1P54107 249 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 GALK2Q01415 458 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 DAG1Q14118 895 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 TAB1Q15750 504 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 PGGHGQ32M88 737 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.14□□□□□ -0.63
RPUSD4-208ENST00000533628 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms