RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-210	ENST00000527027	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NPTN	Q9Y639	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	F13B	P05160	661 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CD55	P08174	381 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SBK2	P0C263	348 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CDA	P32320	146 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	IDH3A	P50213	366 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	VWF	P04275	2813 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC2A10	O95528	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	FUT1	P19526	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PSG4	Q00888	419 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DEFA6	Q01524	100 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF154	Q13106	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	BAMBI	Q13145	260 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SGCA	Q16586	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	AGK	Q53H12	422 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SPRN	Q5BIV9	151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027		H3BSA7	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	IGHM	P01871	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	MT-ND1	P03886	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	CD247	P20963	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	AQP2	P41181	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC6A9	P48067	706 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PPP1CB	P62140	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	IL13RA1	P78552	427 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRU-210	ENST00000527027	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms