RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAP1B	P61224	184 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAP1A	P62834	184 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALK2	Q01415	458 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIN1	Q13671	783 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGCA	Q16586	387 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52J3	Q8NH60	311 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASD2	Q96D21	266 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBP7	Q96R05	134 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS37	A4D1T9	235 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R233	179 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCR1	O76036	304 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFB2	O95178	105 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPX	P02790	462 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	T-ENOL	P0DO92	83 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2C1	P13056	603 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V1B2	P21281	511 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCP2	P55851	309 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH20	Q9HBT6	801 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PPL8	197 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC119B	A6NIH7	251 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	AHCYL1	O43865	530 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ICMT	O60725	284 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	LILRA1	O75019	489 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC12	O95881	172 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTH	P01270	115 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	TACSTD2	P09758	323 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAT2	P11245	290 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSR1	P21757	451 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	STOM	P27105	288 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDHA	P31040	664 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	APLNR	P35414	380 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSF2	Q03933	536 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLP2	Q04941	152 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARTPT	Q16568	116 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCTN6	O00399	190 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMNN	O75496	209 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	GADD45G	O95257	159 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM107A	O95990	144 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF23	P17027	643 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGA2	P17301	1181 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL8A2	P25067	703 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRM2	P31350	389 aa		10.86	□□□□□ -0.67

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