RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508139.1

FGFR4-210, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 5

Gene FGFR4, Length 720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-210ENST00000508139 PIP5K1CO60331 668 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 OR6A2O95222 327 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 PATE4P0C8F1 98 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 FUT1P19526 365 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 PRDX6P30041 224 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 RAD52P43351 418 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 CSNK1A1P48729 337 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 LCN2P80188 198 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 FHL1Q13642 323 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 MELKQ14680 651 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 SNX33Q8WV41 574 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 SGTBQ96EQ0 304 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 TPD52L3Q96J77 140 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.67□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 CLDN25C9JDP6 229 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 RNF13O43567 381 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 NUDT2P50583 147 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ERVS71-1P61550 626 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 GLO1Q04760 184 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ST3GAL3Q11203 375 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 USP51Q70EK9 711 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ASB10Q8WXI3 467 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 MED31Q9Y3C7 131 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 CENPBD1B2RD01 187 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 J3KTA2 159 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 UBL3O95164 117 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 UMPSP11172 480 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 PRTN3P24158 256 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 AQP2P41181 271 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 PSME3P61289 254 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 SKA3Q8IX90 412 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 LZICQ8WZA0 190 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF566Q969W8 418 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 GAL3ST1Q99999 423 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 GPR160Q9UJ42 338 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR4-210ENST00000508139 ISPDA4D126 451 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 DHHO43323 396 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 HIST1H2ABP04908 130 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 IFNW1P05000 195 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 F13BP05160 661 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 LCKP06239 509 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 CCL2P13500 99 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 CRYBB2P43320 205 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 GYS2P54840 703 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 SELENOVP59797 346 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 TEKQ02763 1124 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 IFI44LQ53G44 452 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 TIMD4Q96H15 378 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 INIPQ9NRY2 104 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 GMNCA6NCL1 334 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 NDUFAB1O14561 156 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 SERPINA1P01009 418 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 IGHG1P01857 330 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 NCK1P16333 377 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 MAKP20794 623 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 GATA3P23771 443 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 BAMBIQ13145 260 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 C10orf128Q5T292 105 aa14.63□□□□□ -0.07
FGFR4-210ENST00000508139 DOK3Q7L591 496 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms