RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 HSF2Q03933 536 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 GLO1Q04760 184 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 KLHL12Q53G59 568 aa11.7□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.7□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 SSTR2P30874 369 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NR1H2P55055 460 aa11.69□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 PLP2Q04941 152 aa11.69□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC29A1Q99808 456 aa11.68□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 TVP23AA6NH52 213 aa11.67□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 SNAP29O95721 258 aa11.67□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM8P78325 824 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB39AQ14964 217 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 NRN1LQ496H8 165 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM27BQ5VT28 67 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF627Q7L945 461 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 CPOQ8IVL8 374 aa11.67□□□□□ -0.54
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