RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 SLC36A3Q495N2 470 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZBED5Q49AG3 693 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ALG10Q5BKT4 473 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C12orf73Q69YU5 71 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR2A2Q6IF42 318 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 VWA1Q6PCB0 445 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CASP12Q6UXS9 341 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PXKQ7Z7A4 578 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ADCK1Q86TW2 530 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OAFQ86UD1 273 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CBR4Q8N4T8 237 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ASB10Q8WXI3 467 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ROBO4Q8WZ75 1007 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF570Q96NI8 536 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RDH12Q96NR8 316 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR2M2Q96R28 347 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SNX18Q96RF0 628 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TRIB1Q96RU8 372 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TIGARQ9NQ88 270 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C8orf4Q9NR00 106 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CMC2Q9NRP2 79 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 INIPQ9NRY2 104 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GLRX2Q9NS18 164 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KRT84Q9NSB2 600 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MED29Q9NX70 200 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IL20Q9NYY1 176 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EMC3Q9P0I2 261 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 AASSQ9UDR5 926 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MED12LQ86YW9 2145 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SVILO95425 2214 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZGRF1Q86YA3 2104 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CENPBD1B2RD01 187 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C11orf98E9PRG8 122 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 G3V2T6 193 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MS4A18H0YCH9 400 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 H0YHG0 523 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GNGT2O14610 69 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GPR171O14626 319 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PTP4A3O75365 173 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PPP1R3DO95685 299 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGHG1P01857 330 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TK1P04183 234 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 POU2F1P14859 743 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF20P17024 532 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF43P17038 809 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 AGAP20933 346 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PRKACGP22612 351 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EPHA2P29317 976 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GRK5P34947 590 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OPRM1P35372 400 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR3A2P47893 321 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PCYT1AP49585 367 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms