RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RNF185Q96GF1 192 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CCNB2O95067 398 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 RALBP11234 206 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OMGP23515 440 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA1P43355 309 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PON3Q15166 354 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 THEM4Q5T1C6 240 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SPESP1Q6UW49 350 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N7P7 452 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR4S2Q8NH73 311 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PEX13Q92968 403 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR5B12Q96R08 314 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CD84Q9UIB8 345 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN11O75508 207 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 RETP07949 1114 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 F2RP25116 425 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MXD1Q05195 221 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TRAM2Q15035 370 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR7A5Q15622 319 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LCE1EQ5T753 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC58Q96CX6 371 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ZYG11BQ9C0D3 744 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NTN4Q9HB63 628 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CRLF2Q9HC73 371 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 WDR62O43379 1518 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CIB4A0PJX0 185 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP6O75344 327 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV2-23P01705 113 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINE2P07093 398 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL5P42830 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A9P82251 487 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MAB21L1Q13394 359 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD5Q16401 504 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 STUMQ69YW2 141 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 FAM184AQ8NB25 1140 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 IL22RA2Q969J5 263 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CYYR1Q96J86 154 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 L7N2F9 121 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CA11O75493 328 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A6P0DMU7 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A5P0DMU8 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A7P0DMV0 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3BP20337 219 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MDKP21741 143 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF9P41273 254 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CYB561P49447 251 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CRISP3P54108 245 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-5P60370 271 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SP4Q02446 784 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 TAAR1Q96RJ0 339 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
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