RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MISPQ8IVT2 679 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 EID3Q8N140 333 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 COX18Q8N8Q8 333 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 OR5R1Q8NH85 324 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GPR151Q8TDV0 419 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GGHQ92820 318 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MAGED4Q96JG8 741 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 COQ7Q99807 217 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 HES7Q9BYE0 225 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 UBQLN3Q9H347 655 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PROK2Q9HC23 129 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GPR173Q9NS66 373 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 DEPPQ9NTK1 212 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 EXD2Q9NVH0 621 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 RTTNQ86VV8 2226 aa4.9□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MED12Q93074 2177 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A096LPI6 279 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A1W2PP11 408 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A1W2PQD3 144 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GMNCA6NCL1 334 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 F8VVB4 439 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 F8VWA3 439 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 TMEM178BH3BS89 294 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 FADS1O60427 444 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CCDC22O60826 627 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ICOSLGO75144 302 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 STX11O75558 287 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 KCNK2O95069 426 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ANP32DO95626 131 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 LDLRP01130 860 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 HPNP05981 417 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 STSP08842 583 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ACP2P11117 423 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 HPGDP15428 266 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP6V1C1P21283 382 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 EVI2BP34910 448 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PTGDSP41222 190 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SELENOVP59797 346 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PLGLB1Q02325 96 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 IL24Q13007 206 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GNA13Q14344 377 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 MAPRE2Q15555 327 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NNATQ16517 81 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 DUSP5Q16690 384 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 STHQ8IWL8 128 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 RNF148Q8N7C7 305 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 THAP6Q8TBB0 222 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ZFP90Q8TF47 636 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 CCDC107Q8WV48 283 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 GTF2H4Q92759 462 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC35G5Q96KT7 338 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF597Q96LX8 424 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 OR7D2Q96RA2 312 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NODALQ96S42 347 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NHLRC3-205ENST00000485407 SIRPDQ9H106 197 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms