RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ARGFXA6NJG6 315 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5K4A6NMS3 321 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 UMAD1C9J7I0 102 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 NDUFS1P28331 727 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 GUCA2AQ02747 115 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 HMGN3Q15651 99 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM215Q68D42 235 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC30A7Q8NEW0 376 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ETV7Q9Y603 341 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 H7C1C5 153 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CD3DP04234 171 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 NPBWR1P48145 328 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 POU3F4P49335 361 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LCN6P62502 163 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 DUSP2Q05923 314 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 DUSP8Q13202 625 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LIPNQ5VXI9 398 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PPH5 198 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 BHLHE40O14503 412 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CALCBP10092 127 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 SQSTM1Q13501 440 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 STAC2Q6ZMT1 411 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MIB2Q96AX9 1013 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 FOXN4Q96NZ1 517 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MED9Q9NWA0 146 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 NME2P1O60361 137 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CTAG1AP78358 180 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDGFRLQ15198 375 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5V1Q9UGF6 321 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PP55 124 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PLSCR5A0PG75 271 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 HMSDA8MTL9 139 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ABCD4O14678 606 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNFSF12O43508 249 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 EPPINO95925 133 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 F13BP05160 661 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZGLP1P0C6A0 271 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 VIPR2P41587 438 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM46BQ96A09 425 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LUZP4Q9P127 313 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CBY3A6NI87 242 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CTDSPLO15194 276 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 GREM1O60565 184 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 YIF1AO95070 293 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 THBS1P07996 1170 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ITGB8P26012 769 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ACY1Q03154 408 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 SERTAD2Q14140 314 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 Q6ZRG5 221 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR2L8Q8NGY9 312 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR1S1Q8NH92 325 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 Q96M85 177 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TSSK2Q96PF2 358 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PAX6P26367 422 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPS27P42677 84 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PJVKQ0ZLH3 352 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 ALG10Q5BKT4 473 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR2A2Q6IF42 318 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 LILRB2Q8N423 598 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 RFLNBQ8N5W9 214 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 LINC01555Q8NAE3 123 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5B12Q96R08 314 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A087WV62 115 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 TGOLN2O43493 480 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR4E1P0C645 316 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 USP53Q70EK8 1073 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRGPREQ86SM8 312 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms