RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	EFNB3	Q15768	340 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FXN	Q16595	210 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NRN1L	Q496H8	165 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MEST	Q5EB52	335 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF75A	Q96N20	296 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf49	A4QMS7	147 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880		M0R233	179 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A7	O60669	478 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CSF3	P09919	207 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MSR1	P21757	451 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	STOM	P27105	288 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A6	P31641	620 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GLRX	P35754	106 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ALDH3B1	P43353	468 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PCBD1	P61457	104 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MTX3	Q5HYI7	312 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OTP	Q5XKR4	325 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LRP11	Q86VZ4	500 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NABP1	Q96AH0	204 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GPA33	Q99795	319 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SYT4	Q9H2B2	425 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MUC13	Q9H3R2	512 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GYG2	O15488	501 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SYNGR3	O43761	229 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MGRN1	O60291	552 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PTP4A3	O75365	173 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CST2	P09228	141 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	T-ENOL	P0DO92	83 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A16	P16260	332 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	RAD52	P43351	418 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ERVS71-1	P61550	626 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GLO1	Q04760	184 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FAM27B	Q5VT28	67 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LEG1	Q6P5S2	330 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD8	Q96LT4	415 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DOK1	Q99704	481 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM15	Q9C019	465 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880		U3KQV3	271 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM129	A0AVI4	362 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	INAFM1	C9JVW0	142 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	IMPA2	O14732	288 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	KRT36	O76013	467 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	UBOX5	O94941	541 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CCNB2	O95067	398 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	REN	P00797	406 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DAO	P14920	347 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CTLA4	P16410	223 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PSG4	Q00888	419 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A2	Q01362	244 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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