RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZUT4 128 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MIER3Q7Z3K6 550 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ASPGQ86U10 573 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 HID1Q8IV36 788 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PALM2Q8IXS6 379 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZBED8Q8IZ13 594 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SPARTQ8N0X7 666 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ABHD12Q8N2K0 398 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 BBS1Q8NFJ9 593 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 OR9I1Q8NGQ6 314 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR9A2Q8NGT5 310 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 HUS1BQ8NHY5 278 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 EHD1Q9H4M9 534 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 WDR41Q9HAD4 459 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 BCL2L10Q9HD36 194 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 G6PC2Q9NQR9 355 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 KLHL3Q9UH77 587 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 POLG2Q9UHN1 485 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR52A1Q9UKL2 312 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 A4GNTQ9UNA3 340 aa-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-2.44□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 OR11H12B2RN74 326 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DIRC3C9JPN6 131 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CCL24O00175 119 aa-2.45□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 KMOO15229 486 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FGF16O43320 207 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 AP1G2O75843 785 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR2B3O76000 313 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR6A2O95222 327 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 NPTXRO95502 500 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DDX58O95786 925 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 NDST3O95803 873 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 INSP01308 110 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 IGLV3-1P01715 115 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 IGHMP01871 453 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MT-ND1P03886 318 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-DPB1P04440 258 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CYBBP04839 570 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SFTA3P0C7M3 94 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM49P0CI25 452 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM49CP0CI26 452 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 T-ENOLP0DO92 83 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CKBP12277 381 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PORP16435 677 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ABOP16442 354 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RPL17P18621 184 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 EVI2AP22794 236 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TACR1P25103 407 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ELK4P28324 431 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MAPK1P28482 360 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CDKN2BP42772 138 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA8P43361 318 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KCNJ1P48048 391 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PREPP48147 710 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LMAN1P49257 510 aa-2.45□□□□□ -2.8
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