RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 TENM2Q9NT68 2774 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LCE6AA0A183 80 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PRD5 423 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PRF3 423 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PRM7 423 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 E9PQ18 207 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 C11orf98E9PRG8 122 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SURF4O15260 269 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 NPHS1O60500 1241 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO24O75426 580 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 QDPRP09417 244 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CD28P10747 220 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 G6PDP11413 515 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MMP9P14780 707 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CPT2P23786 658 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SLC6A2P23975 617 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MMP16P51512 607 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 EFNB2P52799 333 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ARF6P62330 175 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 COX10Q12887 443 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 PSG7Q13046 419 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 TAF11Q15544 211 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LIN52Q52LA3 116 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 KANK2Q63ZY3 851 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RNF144BQ7Z419 303 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LCA5Q86VQ0 697 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SCAIQ8N9R8 606 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC63Q8NA47 563 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 AGR3Q8TD06 166 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM54Q969K7 222 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ASPNQ9BXN1 380 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 GCM1Q9NP62 436 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MED4Q9NPJ6 270 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 IL19Q9UHD0 177 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 EMCNQ9ULC0 261 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.93□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 COL7A1Q02388 2944 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LRRN3E7EW58 273 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ATP8B1O43520 1251 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 FZD7O75084 574 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 GLRA3O75311 464 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 OR6A2O95222 327 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 FBP1P09467 338 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ADORA3P0DMS8 318 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 EPHA3P29320 983 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 KIR2DS4P43632 304 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGDIAP52565 204 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJB13P59910 316 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 GNG11P61952 73 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SLC7A5Q01650 507 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 PUDPQ08623 228 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MELKQ14680 651 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LY6EQ16553 131 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF404Q494X3 552 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 Q6ZR03 302 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 SPERTQ8NA61 448 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF566Q969W8 418 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 C3orf30Q96M34 536 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEB18Q96M61 343 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-222ENST00000449504 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms