RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS18P62269 152 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 EBPQ15125 230 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXD1Q9GZZ0 328 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C65A6NJZ3 312 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 F5H5K5 113 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL4P13236 92 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ARSBP15848 533 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 M6PRP20645 277 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 MTNR1BP49286 362 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF4P78317 190 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 GPLD1P80108 840 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ACBD4Q8NC06 268 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52I2Q8NH67 350 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT33AO76009 404 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SIX6O95475 246 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PTH2RP49190 550 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 GUCA2AQ02747 115 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 LYPD8Q6UX82 237 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF440Q8IYI8 595 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF615Q8N8J6 731 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 UPRTQ96BW1 309 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PDCD5O14737 125 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PTP4A3O75365 173 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CTRB1P17538 263 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RIDAP52758 137 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 LTBQ06643 244 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 DCXRQ7Z4W1 244 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SPEM1Q8N4L4 309 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RBP7Q96R05 134 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CFHR1Q03591 330 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC7A6Q92536 515 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM19Q96E16 107 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ATG12O94817 140 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 WDPCPO95876 746 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CTLA4P16410 223 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB3AP20336 220 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SDHAP31040 664 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 VEGFCP49767 419 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 DCDP81605 110 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXF1Q12946 379 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CEBPEQ15744 281 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ELP2Q6IA86 826 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC18B1Q6NT16 456 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF227Q86WZ6 799 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CASTOR1Q8WTX7 329 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM234Q8WY98 164 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF524Q96C55 264 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM43Q9BTV4 400 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 FITM1A5D6W6 292 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 LILRA5A6NI73 299 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 C9J4A7 227 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A5P22732 501 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ETV6P41212 452 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ART1P52961 327 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 MESTQ5EB52 335 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF283Q8N7M2 679 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRNA9Q9UGM1 479 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR19A6NJB7 356 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 FABP7O15540 132 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CALCBP10092 127 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 EPXP11678 715 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 STOMP27105 288 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CIB4A0PJX0 185 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHA1P01876 353 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 GAS1P54826 345 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms