RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433027.5

RBM39-213, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 5

Gene RBM39, Length 611 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-213	ENST00000433027	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	COG8	Q96MW5	612 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	RERGL	Q9H628	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ATM	Q13315	3056 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027		E9PLN8	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	WISP2	O76076	250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TF	P02787	698 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CST2	P09228	141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CD53	P19397	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	DCTD	P32321	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	NTF4	P34130	210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	OPRM1	P35372	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ROM1	Q03395	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	AQP6	Q13520	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SGCD	Q92629	289 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	FOXB1	Q99853	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	PIGM	Q9H3S5	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027		A0A1W2PPL8	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SELENOF	O60613	162 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	UPK3A	O75631	287 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SEC14L2	O76054	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CD1A	P06126	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	CTSS	P25774	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ETV1	P50549	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ETFDH	Q16134	617 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027		Q6ZT83	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	NSMAF	Q92636	917 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	POLE	Q07864	2286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	PTH	P01270	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SCG5	P05408	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	KRT8	P05787	483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	TGM4	P49221	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ZNF85	Q03923	595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	PIGF	Q07326	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM39-213	ENST00000433027	ECH1	Q13011	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms