RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	APLNR	P35414	380 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT2	P50583	147 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH15	P55291	814 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HSF2	Q03933	536 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OAF	Q86UD1	273 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF5	Q969M3	257 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RBP7	Q96R05	134 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX18	Q96RF0	628 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51B6	Q9H340	312 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		15.15	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf100	A8MU93	164 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTA4	O15217	222 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ICMT	O60725	284 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RP2	O75695	350 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LCK	P06239	509 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CST2	P09228	141 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	STOM	P27105	288 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CFP	P27918	469 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENOV	P59797	346 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PSG4	Q00888	419 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SGCA	Q16586	387 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		15.14	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NIZ1	184 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP8B1	O43520	1251 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-13	P01766	116 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NCK1	P16333	377 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LAP3	P28838	519 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDX6	P30041	224 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT5A	P41221	380 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEB1	P43366	347 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM33	P57088	247 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP1B	P61224	184 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PSME3	P61289	254 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP1A	P62834	184 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-25	P63136	954 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM122B	Q7Z309	247 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM162A	Q96A26	154 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR160	Q9UJ42	338 aa		15.13	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PRQ8	180 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CD14	P08571	375 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR4	P46093	362 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DGCR6	Q14129	220 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED5	Q49AG3	693 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	METRN	Q9UJH8	293 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		15.12	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf49	A4QMS7	147 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT9B	O14905	357 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	AHCYL1	O43865	530 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SCG5	P05408	212 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MSR1	P21757	451 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNO	P22674	350 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LIMS1	P48059	325 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNI	Q14094	377 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MOG	Q16653	247 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		15.11	■□□□□ 0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MEST	Q5EB52	335 aa		15.11	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms