RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 DLX1P56177 255 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 TWF1Q12792 350 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF726P1Q15940 193 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGGHGQ32M88 737 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 GATSQ8NAP1 163 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 BAALCQ8WXS3 180 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERPINB12Q96P63 405 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARHGDIGQ99819 225 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXC2Q99958 501 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 DEFB129Q9H1M3 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD274Q9NZQ7 290 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ASF1AQ9Y294 204 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 AKNAQ7Z591 1439 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADGRL1O94910 1474 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GVI7 797 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1W2PQ72 361 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERICH2A1L162 156 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 LYRM9A8MSI8 78 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 HIDE1A8MVS5 230 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RFXANKO14593 260 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CETN3O15182 167 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 XRCC2O43543 280 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ICOSLGO75144 302 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 MPDU1O75352 247 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRLF1O75462 422 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNAPINO95295 136 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARG1P05089 322 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CMA1P23946 247 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERPINB5P36952 375 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSNK1A1P48729 337 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 APOC4P55056 127 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 DIO3P55073 304 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAS2R19P59542 299 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSMC5P62195 406 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 FZD2Q14332 565 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZSCAN26Q16670 478 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q1RN00 199 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 FHL5Q5TD97 284 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF170Q96K19 258 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 BBS2Q9BXC9 721 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLN6Q9NWW5 311 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 XCL2Q9UBD3 114 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTSFQ9UBX1 484 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 H0YHG0 523 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 TIMP1P01033 207 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLK1P06870 262 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CALM1P0DP23 149 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CALM2P0DP24 149 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CALM3P0DP25 149 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSMC3P17980 439 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 COX7A1P24310 79 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRKAR2BP31323 418 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSKP41240 450 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSNK1DP48730 415 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 AQP6Q13520 282 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARFRP1Q13795 201 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA0087Q14695 138 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANGPT1Q15389 498 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZBED5Q49AG3 693 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS3AP9-201ENST00000417027 MARC1Q5VT66 337 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms