RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 GGT3PA6NGU5 568 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ADAM10O14672 748 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A7O60669 478 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A5O76082 557 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DQA2P01906 255 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 OR3A3P47888 321 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K6P52564 334 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 RIDAP52758 137 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 GLO1Q04760 184 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 OR10AC1Q8NH08 325 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 MS4A3Q96HJ5 214 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 OR10A4Q9H209 315 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 AUP1Q9Y679 476 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 MEGF11A6BM72 1044 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 FTCDNL1E5RQL4 147 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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PMS1-205ENST00000409985 CFIP05156 583 aa21.37■■□□□ 1.01
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PMS1-205ENST00000409985 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ESCO2Q56NI9 601 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ZNF626Q68DY1 528 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 DNM1P34Q6PK57 102 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 DEGS2Q6QHC5 323 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 NLRC3Q7RTR2 1065 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 CATSPERDQ86XM0 798 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 UXS1Q8NBZ7 420 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 LOXL4Q96JB6 756 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.37■■□□□ 1.01
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PMS1-205ENST00000409985 SDC3O75056 442 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 CD2P06729 351 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 PCK2Q16822 640 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 KRT77Q7Z794 578 aa21.37■■□□□ 1.01
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PMS1-205ENST00000409985 CEP76Q8TAP6 659 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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PMS1-205ENST00000409985 ABHD6Q9BV23 337 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 FANCFQ9NPI8 374 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 DHDHQ9UQ10 334 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 CIB4A0PJX0 185 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-205ENST00000409985 G3V3Q6 166 aa21.35■■□□□ 1.01
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