RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS50Q9UI38 385 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MED12Q93074 2177 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF407Q9C0G0 2248 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM129A0AVI4 362 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TFP02787 698 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MT-ND5P03915 603 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KRT8P05787 483 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TACSTD2P09758 323 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HSMCR30P0CW71 290 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GLI4P10075 376 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OPRM1P35372 400 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CAPZA2P47755 286 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HCCSP53701 268 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 WNT4P56705 351 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TGFBR3Q03167 851 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PMPCAQ10713 525 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TEX30Q5JUR7 227 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 VWA1Q6PCB0 445 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KRT77Q7Z794 578 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ATCAYQ86WG3 371 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC18Q8N456 261 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR52N1Q8NH53 320 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OTOSQ8NHW6 89 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf198Q9H425 327 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EMC7Q9NPA0 242 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OSGIN2Q9Y236 505 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CIB4A0PJX0 185 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 E9PLN8 166 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 J3QLW9 94 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 J3QRE1 110 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SEC14L2O76054 403 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF19P17023 458 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PCMT1P22061 227 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MPGP29372 298 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HOXC12P31275 282 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PCBD1P61457 104 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF85Q03923 595 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EGR3Q06889 387 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FOXF2Q12947 444 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 BLMHQ13867 455 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IRF3Q14653 427 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GUSBP1Q15486 140 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SPHARQ15513 63 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TAF13Q15543 124 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KCNMB1Q16558 191 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NRN1LQ496H8 165 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF544Q6NX49 715 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 BEND4Q6ZU67 534 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DCXRQ7Z4W1 244 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GPR141Q7Z602 305 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR52N5Q8NH56 324 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RND1Q92730 232 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C4orf36Q96KX1 117 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SIGLEC11Q96RL6 698 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 WACQ9BTA9 647 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MROQ9BYG7 248 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PIGMQ9H3S5 423 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RNF121Q9H920 327 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SIAEQ9HAT2 523 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 BATF3Q9NR55 127 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MALT1Q9UDY8 824 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms