RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 DAP3P51398 398 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ERVK-25P63136 954 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PSG4Q00888 419 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNFRSF17Q02223 184 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CAMK2DQ13557 499 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 HES1Q14469 280 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 GUSBP1Q15486 140 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 KLHL40Q2TBA0 621 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIM16LQ309B1 348 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRIT3Q3SXY7 679 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PHYHD1Q5SRE7 291 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 AVPI1Q5T686 147 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 C12orf60Q5U649 245 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 UTS2BQ765I0 119 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 BNIPLQ7Z465 357 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-54P-201ENST00000365563 ERO1BQ86YB8 467 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-54P-201ENST00000365563 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 UXS1Q8NBZ7 420 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4A16Q8NH70 328 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CNIH3Q8TBE1 160 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 M1APQ8TC57 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CMTM7Q96FZ5 175 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR8B2Q96RD0 313 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACPTQ9BZG2 426 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRT23Q9C075 422 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 NACA2Q9H009 215 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 GBA3Q9H227 469 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 GHITMQ9H3K2 345 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 C1orf123Q9NWV4 160 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEC14L3Q9UDX4 400 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SUN2Q9UH99 717 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACOT9Q9Y305 439 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATG2BQ96BY7 2078 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 POLEQ07864 2286 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A1B0GU33 70 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 A0A1B0GUS0 222 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR6C74A6NCV1 312 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 URADA6NGE7 173 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM74A7A6NL05 159 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRDCB7Z8K6 153 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGLL5B9A064 214 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 J3KRW8 73 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-54P-201ENST00000365563 NME2P1O60361 137 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 UPK3AO75631 287 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SCO1O75880 301 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PGM3O95394 542 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 NRASP01111 189 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 HRASP01112 189 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRASP01116 189 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPN2P04844 631 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CAPN1P07384 714 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 GSTT2P0CG29 244 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 GSTT2BP0CG30 244 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CD28P10747 220 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCNB1P14635 433 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 AKR1B1P15121 316 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 IL12BP29460 328 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRDX2P32119 198 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 RORAP35398 523 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PCK1P35558 622 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PKNOX1P55347 436 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF92Q03936 586 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPP2Q13103 211 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 DUSP7Q16829 419 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM74A3Q4VXF1 159 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 METTL21CQ5VZV1 264 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM270Q6UE05 265 aa-0.8□□□□□ -2.54
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