RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 Q3ZCU0 254 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF561Q8N587 486 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DOK4Q8TEW6 326 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PFDN5Q99471 154 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GAL3ST1Q99999 423 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FGF22Q9HCT0 170 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.22■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MCIDASD6RGH6 385 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ADH1BP00325 375 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CSN2P05814 226 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FAM157CP0CG43 387 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AVPR2P30518 371 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR52W1Q6IF63 320 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ABHD13Q7L211 337 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR2L3Q8NG85 312 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SGK3Q96BR1 496 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ST8SIA5O15466 376 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 FBXO45P0C2W1 286 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ODF4Q2M2E3 257 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 IER2Q9BTL4 223 aa15.21■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NID1P14543 1247 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PGDP52209 483 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEM106AQ96A25 262 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 EDEM2Q9BV94 578 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 H0Y8X5 98 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 IGHV2-5P01817 119 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 DCUN1D4Q92564 292 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 APOOQ9BUR5 198 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OBP2AQ9NY56 170 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CD14P08571 375 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RNF224P0DH78 156 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR10K2Q6IF99 312 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SEH1LQ96EE3 360 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.2■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 A6NLC8 198 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 K7EQS6 105 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ITGA5P08648 1049 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF28P17035 718 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CAV2P51636 162 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SCAND1P57086 179 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 HGFACQ04756 655 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R1AQ13522 171 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZIC1Q15915 447 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 GXYLT1Q4G148 440 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 FAM220AQ7Z4H9 259 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 VSIG4Q9Y279 399 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.19■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms