RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ASH2LQ9UBL3 628 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR2J2O76002 312 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ERVK-16P61578 105 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR52I2Q8NH67 350 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 WWTR1Q9GZV5 400 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OCEL1Q9H607 264 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 MED29Q9NX70 200 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 IL20Q9NYY1 176 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF254O75437 659 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ETV6P41212 452 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SELENBP1Q13228 472 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 XAF1Q6GPH4 301 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TMEM81Q6P7N7 255 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 AKIP1Q9NQ31 210 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 FITM1A5D6W6 292 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-2O95096 273 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 UBBP0CG47 229 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 DGCR2P98153 550 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TMEM178AQ8NBL3 297 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR4Q3Q8NH05 313 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 LILRB4Q8NHJ6 448 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RAB9BQ9NP90 201 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GPR3P46089 330 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 BTG1P62324 171 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RNF4P78317 190 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 FAPQ12884 760 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 UCN3Q969E3 161 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF649Q9BS31 505 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CACNA1CQ13936 2221 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 MSR1P21757 451 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 IL2RGP31785 369 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 FAM71CQ8NEG0 241 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ZG16BQ96DA0 208 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 COPS3Q9UNS2 423 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 DEFB123Q8N688 67 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PAQR8Q8TEZ7 354 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NRTNQ99748 197 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 S1PR5Q9H228 398 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PRELID1Q9Y255 219 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 POM121CA8CG34 1229 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 HSPB6O14558 160 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-9P01782 118 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PMP2P02689 132 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 EVX1P49640 407 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 DOK3Q7L591 496 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GABRG3Q99928 467 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 NUDT9Q9BW91 350 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 FAM166BA8MTA8 275 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SGCEO43556 437 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 HRO43593 1189 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PIAS2O75928 621 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 TNFSF4P23510 183 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 EGR3Q06889 387 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OTPQ5XKR4 325 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GPBAR1Q8TDU6 330 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 A0A0D9SG52 128 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 ACTL6BO94805 426 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 DDOSTP39656 456 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 OR51E1Q8TCB6 317 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 E9PI62 339 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 AIPO00170 330 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CBX7O95931 251 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 APEHP13798 732 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 C21orf58P58505 322 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 LIPHQ8WWY8 451 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 GLTPQ9NZD2 209 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 KCNG2Q9UJ96 466 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 PLXNB2O15031 1838 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-201ENST00000345716 CHRM2P08172 466 aa18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms