RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO45P0C2W1 286 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAOAP21397 527 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPZP25189 248 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HTR5AP47898 357 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ETV3LQ6ZN32 361 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC20BQ86Y33 519 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DOK4Q8TEW6 326 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC6Q99741 560 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MICU1Q9BPX6 476 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WIF1Q9Y5W5 379 aa20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO24O75426 580 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRG1P02750 347 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FCGR3AP08637 254 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADRB3P13945 408 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SELLP14151 372 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HTRA3P83110 453 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AWAT2Q6E213 333 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF614Q8N883 585 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POMT1Q9Y6A1 747 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NQO2P16083 231 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SKP1P63208 163 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUBPLQ8TB37 319 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MALSU1Q96EH3 234 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMF1Q96S06 567 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PFDN5Q99471 154 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GGACTQ9BVM4 153 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NMES1Q9C002 83 aa20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DBX1A6NMT0 343 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H3BSH0 61 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GABRA3P34903 492 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EMDP50402 254 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DMWDQ09019 674 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHRS11Q6UWP2 260 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZAR1Q86SH2 424 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELOA3Q8NG57 546 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KPTNQ9Y664 436 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A087WV62 115 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C5orf51A6NDU8 294 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACKR3P25106 362 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAM8P78325 824 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ODF4Q2M2E3 257 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GXYLT1Q4G148 440 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF425Q6IV72 752 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCTD9Q7L273 389 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXD3Q8N9H8 876 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR5B2Q96R09 309 aa20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9JQL5 133 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLP1RP43220 463 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYCSP99999 105 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK3Q00526 305 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMGN3Q15651 99 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf152Q5JTZ5 239 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIRREL2Q6UWL6 708 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRGPRFQ96AM1 343 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INHAP05111 366 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSN2P05814 226 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB5AP20339 215 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRPS1P60891 318 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB2AP61019 212 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSSK2Q96PF2 358 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPSB2Q99619 263 aa20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPS10P5Q9NQ39 176 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms