RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 CLUP10909 449 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 BDKRB2P30411 391 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 MMP15P51511 669 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 C14orf144Q96I85 54 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 LAT2Q9GZY6 243 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SPEGQ15772 3267 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 REM1O75628 298 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 HES5Q5TA89 166 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 APOOLQ6UXV4 268 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 NAA40Q86UY6 237 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 C4orf36Q96KX1 117 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CMTM3Q96MX0 182 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 C17orf105B2RV13 164 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SERPINA3P01011 423 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CNR1P21554 472 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 DCTDP32321 178 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RORAP35398 523 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 POU3F4P49335 361 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 NUBP1P53384 320 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 HSD11B2P80365 405 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SORDQ00796 357 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CFHR1Q03591 330 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF74Q16587 644 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 EMC4Q5J8M3 183 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SSX6Q7RTT6 188 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SPICQ8N5J4 248 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 THAP6Q8TBB0 222 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CLDN23Q96B33 292 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SMIM19Q96E16 107 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 TGM7Q96PF1 710 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 WNT16Q9UBV4 365 aa9.63□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 GIMD1P0DJR0 217 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RAG2P55895 527 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SQSTM1Q13501 440 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CDK5R1Q15078 307 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 HACD4Q5VWC8 232 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF626Q68DY1 528 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR52I2Q8NH67 350 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 A0A1B0GUH1 482 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 TSPAN2O60636 221 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC6A8P48029 635 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 EFNA3P52797 238 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR12D2P58182 307 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 CD226Q15762 336 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ELP5Q8TE02 316 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 GINS4Q9BRT9 223 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 NOX3Q9HBY0 568 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 IFITM10A6NMD0 228 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SPI1P17947 270 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 EGR4Q05215 589 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 C4orf46Q504U0 113 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 OR5J2Q8NH18 312 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PELI1Q96FA3 418 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 MMP25Q9NPA2 562 aa9.62□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF264O43296 627 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 GLCEO94923 617 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 UTS2O95399 124 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 S100PP25815 95 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 DLX5P56178 289 aa9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PKNOX2-201ENST00000298282 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms