RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FSTP19883 344 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 OR1D4P47884 311 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 RIDAP52758 137 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 BAMBIQ13145 260 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 STEAP1BQ6NZ63 245 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 ZNF454Q8N9F8 522 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 OR1J4Q8NGS1 313 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC12Q96GR4 267 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 ATG5Q9H1Y0 275 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 UPB1Q9UBR1 384 aa25.21■■□□□ 1.63
UBP1-201ENST00000283628 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PNPP00491 289 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PLGP00747 810 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PLCXD2Q0VAA5 305 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ASPHD2Q6ICH7 369 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CATSPERDQ86XM0 798 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 NAXDQ8IW45 347 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C9orf40Q8IXQ3 194 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SLC38A6Q8IZM9 456 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A28Q96A46 364 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa25.2■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CD37P11049 281 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PPP3CBP16298 524 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 GMFBP60983 142 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ADAM8P78325 824 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TMUB2Q71RG4 321 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 NDUFAF7Q7L592 441 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CDH26Q8IXH8 852 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ASB5Q8WWX0 329 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 WBP1Q96G27 269 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TMED7Q9Y3B3 224 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 A8MVM7 634 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 H3BMH7 237 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ARPC5O15511 151 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CD3DP04234 171 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 FBXO45P0C2W1 286 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ACSM4P0C7M7 580 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ZNF35P13682 527 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CALCRP30988 508 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PNLIPRP2P54317 469 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R19P59542 299 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 KCNAB1Q14722 419 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CCDC107Q8WV48 283 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C1orf198Q9H425 327 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SCPEP1Q9HB40 452 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 MED11Q9P086 117 aa25.19■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A23A1A5C7 686 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 GOSR2O14653 212 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 LPLP06858 475 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ZP2Q05996 745 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C1orf140Q5VVS0 124 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SCARB1Q8WTV0 552 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 POTEKPQ9BYX7 375 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 WWTR1Q9GZV5 400 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 EXO5Q9H790 373 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CA14Q9ULX7 337 aa25.18■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CDC14CA4D256 554 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ITGB2P05107 769 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CTLA4P16410 223 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 HTR2CP28335 458 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 CRABP1P29762 137 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C2orf68Q2NKX9 166 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TSSK4Q6SA08 328 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 C5orf46Q6UWT4 87 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 GABRG1Q8N1C3 465 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TMEM229BQ8NBD8 167 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 PLPP7Q8NBV4 271 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 ABHD6Q9BV23 337 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 COPS7AQ9UBW8 275 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 SCO1O75880 301 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 GRINAQ7Z429 371 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 OR6M1Q8NGM8 313 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 STK35Q8TDR2 534 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 RLN3Q8WXF3 142 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 DNAJA3Q96EY1 480 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 FOXN4Q96NZ1 517 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 KCNK15Q9H427 330 aa25.17■■□□□ 1.62
UBP1-201ENST00000283628 TMEM138Q9NPI0 162 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms