RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX6Q7RTT6 188 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 BEST4Q8NFU0 473 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C5Q8NGS8 318 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51A7Q8NH64 312 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 NSMAFQ92636 917 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC120Q96HB5 630 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP25Q9NPA2 562 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R5Q9NYW4 299 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 IFITM5A6NNB3 132 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TFP02787 698 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CALCBP10092 127 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CLUP10909 449 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SSTR2P30874 369 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OPCMLQ14982 345 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 M1APQ8TC57 530 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A3Q96HJ5 214 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MCCC2Q9HCC0 563 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA9Q9UGM1 479 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RCE1Q9Y256 329 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SESN1Q9Y6P5 492 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C65A6NJZ3 312 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP1P22413 925 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K8P41279 467 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PON3Q15166 354 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 EXT1Q16394 746 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB561A3Q8NBI2 242 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 WBP1Q96G27 269 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNE5Q9UJ90 142 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10H2O60403 315 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB2O95178 105 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ICAM2P13598 275 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF250P15622 560 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PTNP21246 168 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 EDNRAP25101 427 aa23.67■■□□□ 1.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 NHLRC3Q5JS37 347 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS45Q7RTY3 260 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G3Q9NZ20 509 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ETV7Q9Y603 341 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PLSCR5A0PG75 271 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35E2P0CK97 266 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZP3P21754 424 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 DIO1P49895 249 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF721Q8TF20 911 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR14A2Q96R54 314 aa23.66■■□□□ 1.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa23.65■■□□□ 1.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A4O95047 310 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP4P27487 766 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAND1P57086 179 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 C3P1Q6ZMU1 363 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RIT1Q92963 219 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A7Q96R45 310 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH8Q9NYR8 311 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF281Q9Y2X9 895 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0B4J203 849 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT7O00154 380 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGS2P35354 604 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIOBQ8N635 442 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 GNG8Q9UK08 70 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 RELNP78509 3460 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GWA3 101 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CIB4A0PJX0 185 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM200CA6NKL6 621 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GMDSO60547 372 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 VEGFCP49767 419 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FHL1Q13642 323 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A19Q695T7 634 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 H3F3CQ6NXT2 135 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa23.64■■□□□ 1.37
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