RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 WDR76Q9H967 626 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 COLCA2A8K830 154 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 LRP3O75074 770 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 RNF224P0DH78 156 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 PI3P19957 117 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K3Q99759 626 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM2Q9C040 744 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CKLFQ9UBR5 152 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 B3GALT2O43825 422 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CD8AP01732 235 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ARG1P05089 322 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 DNASE1L1P49184 302 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CDK3Q00526 305 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ELOCQ15369 112 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SCN5AQ14524 2016 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 WRBO00258 174 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SPINT1O43278 529 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 STK17BO94768 372 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SLC25A4P12235 298 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF44P15621 663 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 MAOAP21397 527 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ECH1Q13011 328 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 GPX8Q8TED1 209 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 DHDHQ9UQ10 334 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 C9orf170A2RU37 121 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 C11orf98E9PRG8 122 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CLN5O75503 358 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 MESP2Q0VG99 397 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ZIC1Q15915 447 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ABHD13Q7L211 337 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CDRT4Q8N9R6 151 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQY0 241 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 DCTN6O00399 190 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SFTPBP07988 381 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SPARCP09486 303 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF561Q8N587 486 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 LCN9Q8WX39 176 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 NXPE3Q969Y0 559 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 RHOVQ96L33 236 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 UPK3AO75631 287 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 PMP2P02689 132 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 HTR2CP28335 458 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CD1CP29017 333 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF616Q08AN1 781 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 RUNX2Q13950 521 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 RNF212Q495C1 297 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 FRMD1Q8N878 549 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 MSGN1A6NI15 193 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ADAP1O75689 374 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 PMPCAQ10713 525 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 WDR38Q5JTN6 314 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 ULK3Q6PHR2 472 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 KCNG2Q9UJ96 466 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1B0GTI1 187 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-201ENST00000007722 C5orf52A6NGY3 159 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms