RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 NYXQ9GZU5 481 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CIAO1O76071 339 aa20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C21orf2O43822 256 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTSWP56202 376 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 HTRA3P83110 453 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR108Q9NPR9 543 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.45■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-210ENST00000617904 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUSD4Q5VX71 490 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNKSR1Q969H4 720 aa20.44■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SDSP20132 328 aa20.43■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLRG1Q96E93 195 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 MASTLQ96GX5 879 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIP1O00291 1037 aa20.41■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 CACNA1SQ13698 1873 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGA6P23229 1130 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 TFCP2Q12800 502 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERFEQ4G0M1 354 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.4■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.4■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NTSR2O95665 410 aa20.39■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.39■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-210ENST00000617904 EVI5LQ96CN4 794 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTL9Q8NET4 1388 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 BECN1Q14457 450 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOGA3Q5TF21 947 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPR1P16066 1061 aa20.36■□□□□ 0.85
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