RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF428Q96B54 188 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCER2I3L3R5 266 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 FKBP1BP68106 108 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-209ENST00000616395 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCIRG1Q13488 830 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 MOB2Q70IA6 237 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 COPS6Q7L5N1 327 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 DLG5Q8TDM6 1919 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR25O00155 361 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCARF1Q14162 830 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 EYA3Q99504 573 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEFMP07197 916 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL4A1P02462 1669 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 NFE2L2Q16236 605 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TM4SF4P48230 202 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 NECTIN2Q92692 538 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCN9AQ15858 1988 aa22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM89AQ96GI7 184 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 G3V3G9 751 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 FKTNO75072 461 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF609O15014 1411 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 POTEFA5A3E0 1075 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 UFL1O94874 794 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L8P0C7I0 530 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 GMLQ99445 158 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 SREBF2Q12772 1141 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTTP42858 3142 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 GGA1Q9UJY5 639 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM17Q9Y577 477 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L3A6NCW0 530 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L4A6NCW7 530 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 NF2P35240 595 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 RALBP1Q15311 655 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 KRT24Q2M2I5 525 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRKG1Q13976 671 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSME4Q14997 1843 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALDH1A1P00352 501 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPRYD7Q5W111 196 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 CENPFP49454 3210 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 WNT10BO00744 389 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIPK4P57078 832 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PODNQ7Z5L7 613 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 MXD3Q9BW11 206 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFNL1Q8IU54 200 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 XDHP47989 1333 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms