RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOXB7P09629 217 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CXCL9Q07325 125 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HYPKQ9NX55 129 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WBP1LQ9NX94 342 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUP98P52948 1817 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 G3V3G9 751 aa11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 H7C1D1 291 aa11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RAD17O75943 681 aa11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.17□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C6orf229H3BNL8 230 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LBX1P52954 281 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRT24Q2M2I5 525 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WASHC4Q2M389 1173 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF428Q96B54 188 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM89AQ96GI7 184 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAPNS2Q96L46 248 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EYA3Q99504 573 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SNED1Q8TER0 1413 aa11.16□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAF5O00463 557 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MFRPQ9BY79 579 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RIMBP2O15034 1052 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNAI1P63096 354 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC51AQ86UW1 340 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP2K2P36507 400 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MBIPQ9NS73 344 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COL4A5P29400 1685 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CST9Q5W186 159 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MICALL2Q8IY33 904 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DPF2Q92785 391 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFT57Q9NWB7 429 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 APAF1O14727 1248 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CA12O43570 354 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYD88Q99836 296 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PSMD14O00487 310 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ECE2O60344 883 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPSM2P81274 684 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DOK7Q18PE1 504 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP48Q86UV5 1035 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 YDJCA8MPS7 323 aa11.09□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AOC2O75106 756 aa11.09□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UFL1O94874 794 aa11.09□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.09□□□□□ -0.63
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms