RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTDNEP1O95476 244 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DACT1Q9NYF0 836 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADCY5O95622 1261 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXP2O15409 715 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGA6P23229 1130 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUCY1B3Q02153 619 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.94□□□□□ -0.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.18
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