RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	UFL1	O94874	794 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	KAZALD1	Q96I82	304 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	XDH	P47989	1333 aa		28.45	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	WDR90	Q96KV7	1748 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	GPC2	Q8N158	579 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	TOMM70	O94826	608 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	POTEC	B2RU33	542 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968		G3V3G9	751 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	TRIM27	P14373	513 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	CXCL9	Q07325	125 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TIMM44-208	ENST00000598968	RAD17	O75943	681 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	CHRND	Q07001	517 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	ECE2	O60344	883 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	TNIP1	Q15025	636 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNJ4	P48050	445 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	SCN4A	P35499	1836 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	MEIS3	Q99687	375 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	PLIN1	O60240	522 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	TAF5L	O75529	589 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	GNAI3	P08754	354 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
TIMM44-208	ENST00000598968	EPHX2	P34913	555 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	SCNN1D	P51172	638 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	PSMD14	O00487	310 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	EPS15	P42566	896 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	FSTL1	Q12841	308 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	SNAP23	O00161	211 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TIMM44-208	ENST00000598968	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	KLRK1	P26718	216 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	RLBP1	P12271	317 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.24	■■■□□ 2.11

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