RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 TNNI3KQ59H18 835 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.36■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 MYL6BP14649 208 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.339e-7■□□□□ 9.4
ILF3-217ENST00000589998 COPRSQ9NQ92 184 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FOSBP53539 338 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 TFCP2Q12800 502 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 ARID5BQ14865 1188 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 STX1AQ16623 288 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FEZ1Q99689 392 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 MYD88Q99836 296 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.34■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.34■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.34■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 PFKFB2O60825 505 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 CTAGE5O15320 804 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FGD1P98174 961 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 CEP135Q66GS9 1140 aa23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ILF3-217ENST00000589998 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.33■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 USP27XA6NNY8 438 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SLC39A6Q13433 755 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ZNF592Q92610 1267 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.32■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 A0A087WWV3 80 aa23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CTDNEP1O95476 244 aa23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 GCP02774 474 aa23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 COPS6Q7L5N1 327 aa23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 OGFRQ9NZT2 677 aa23.31■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 NEMFO60524 1076 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 USP28Q96RU2 1077 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ZNF790Q6PG37 636 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 HAUS7Q99871 368 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 USP16Q9Y5T5 823 aa23.3■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 BECN2A8MW95 431 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 APOBRQ0VD83 1088 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 RGPD5Q99666 1765 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 KINO60870 393 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SKILP12757 684 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.29■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SLIT3O75094 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CCDC69A6NI79 296 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 ANO10Q9NW15 660 aa23.28■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 KIF20AO95235 890 aa23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CCZ1BP86790 482 aa23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ILF3-217ENST00000589998 PTPN14Q15678 1187 aa23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 FSIP1Q8NA03 581 aa23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.25■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.25■■□□□ 1.31
ILF3-217ENST00000589998 PPFIA3O75145 1194 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms