RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SIN3BO75182 1162 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 XKR5Q6UX68 686 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WHAMMQ8TF30 809 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIN2AQ12879 1464 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WIPF1O43516 503 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP3K6O95382 1288 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNTN3Q9P232 1028 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NUP160Q12769 1436 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPR182O15218 404 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNFRSF21O75509 655 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGHA2P01877 340 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSAPP07602 524 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNFRSF25Q93038 417 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ASB16Q96NS5 453 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BCRP11274 1271 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADH7P40394 386 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OR13H1Q8NG92 308 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SHROOM2Q13796 1616 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OIP5O43482 229 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PHACTR2O75167 634 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EPXP11678 715 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLAURQ03405 335 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ORC1Q13415 861 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SVOPQ8N4V2 548 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOA3Q8NG57 546 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHRDQ9H2X0 955 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TREHO43280 583 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CES1P23141 567 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLCB3Q01970 1234 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MDFIQ99750 246 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 J3QW42 95 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EREGO14944 169 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ALAS2P22557 587 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOX18P35713 384 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPLD1P80108 840 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DSC3Q14574 896 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CPB1P15086 417 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NRLP54845 237 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SIK1P57059 783 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP3K10Q02779 954 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM35AQ86V20 835 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEFLP07196 543 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HYAL2Q12891 473 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCSK7Q16549 785 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PMEPA1Q969W9 287 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BTBD6Q96KE9 485 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms