RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRCP08575 1304 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 GRM8O00222 908 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGA6P23229 1130 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP2B4P23634 1241 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 EPS15P42566 896 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 SCNN1DP51172 638 aa20.37■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ECE2O60344 883 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CASP7P55210 303 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 HTRA3P83110 453 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 DOK7Q18PE1 504 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 MIER1Q8N108 512 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 SPEF2Q9C093 1822 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CSF1RP07333 972 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM161AQ3B820 660 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.35■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 YDJCA8MPS7 323 aa20.34■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 LTBP1Q14766 1721 aa20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 H7C1D1 291 aa20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTROBQ8N137 903 aa20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.33■□□□□ 0.85
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP350Q5VT06 3117 aa20.33■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 PSMD14O00487 310 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 KLRG1Q96E93 195 aa20.32■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNJ4P48050 445 aa20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 FOXO4P98177 505 aa20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 DPF2Q92785 391 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CREBZFQ9NS37 354 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 PASKQ96RG2 1323 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 PODNQ7Z5L7 613 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 MICALL2Q8IY33 904 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 MED23Q9ULK4 1368 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNDQ07001 517 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-215ENST00000589825 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 SUCLG2Q96I99 432 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 USP17L3A6NCW0 530 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 USP17L4A6NCW7 530 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXW7Q969H0 707 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 COA1Q9GZY4 146 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 UTYO14607 1347 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 PLIN1O60240 522 aa20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 SCN9AQ15858 1988 aa20.23■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 SHTN1A0MZ66 631 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF5LO75529 589 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF16BQ96L93 1317 aa20.22■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
EFTUD2-215ENST00000589825 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms