RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
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GIPC1-211ENST00000589631 XDHP47989 1333 aa25.64■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 PASKQ96RG2 1323 aa25.64■■□□□ 1.7
GIPC1-211ENST00000589631 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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GIPC1-211ENST00000589631 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.58■■□□□ 1.69
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GIPC1-211ENST00000589631 H7C1D1 291 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-211ENST00000589631 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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GIPC1-211ENST00000589631 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-211ENST00000589631 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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GIPC1-211ENST00000589631 PSME4Q14997 1843 aa25.55■■□□□ 1.68
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GIPC1-211ENST00000589631 PODNQ7Z5L7 613 aa25.54■■□□□ 1.68
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GIPC1-211ENST00000589631 UTYO14607 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
GIPC1-211ENST00000589631 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
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GIPC1-211ENST00000589631 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 SHTN1A0MZ66 631 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.5■■□□□ 1.67
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GIPC1-211ENST00000589631 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF609O15014 1411 aa25.49■■□□□ 1.67
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GIPC1-211ENST00000589631 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.49■■□□□ 1.67
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GIPC1-211ENST00000589631 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 CNTNAP1P78357 1384 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-211ENST00000589631 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 GMLQ99445 158 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1B0GUL6 1792 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 TRAF5O00463 557 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 KCNJ4P48050 445 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-211ENST00000589631 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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