RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GIPC1-210ENST00000589497 ATP2B4P23634 1241 aa23.82■■□□□ 1.4
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GIPC1-210ENST00000589497 TNIP1Q15025 636 aa23.82■■□□□ 1.4
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GIPC1-210ENST00000589497 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.65■■□□□ 1.38
GIPC1-210ENST00000589497 MICALL2Q8IY33 904 aa23.65■■□□□ 1.38
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GIPC1-210ENST00000589497 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 CNTROBQ8N137 903 aa23.64■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.63■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 METTL24Q5JXM2 366 aa23.62■■□□□ 1.37
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