RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 H7C1D1 291 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 FOXN1O15353 648 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 SLC4A2P04920 1241 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 SCN9AQ15858 1988 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 MICALL2Q8IY33 904 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 TNS4Q8IZW8 715 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 RTL9Q8NET4 1388 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTIF-206ENST00000588345 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CTSWP56202 376 aa23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 WBP1LQ9NX94 342 aa23.45■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 UFL1O94874 794 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 DOK7Q18PE1 504 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 GGA1Q9UJY5 639 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 PSME4Q14997 1843 aa23.43■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 XDHP47989 1333 aa23.43■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 H7C1W4 665 aa23.43■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 FLIIQ13045 1269 aa23.43■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 ZNF609O15014 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 VAMP4O75379 141 aa23.42■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.42■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.42■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 ECE1P42892 770 aa23.41■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 AIDAQ96BJ3 306 aa23.41■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 CAPNS2Q96L46 248 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 GREM2Q9H772 168 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTIF-206ENST00000588345 SPEF2Q9C093 1822 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 ATP2B4P23634 1241 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 GCKRQ14397 625 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 EGFRP00533 1210 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 CASP7P55210 303 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 G3V3G9 751 aa23.37■■□□□ 1.33
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CTIF-206ENST00000588345 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.37■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 LINS1Q8NG48 757 aa23.37■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.37■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 MED23Q9ULK4 1368 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 PODNQ7Z5L7 613 aa23.35■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 USP48Q86UV5 1035 aa23.35■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 CSF1RP07333 972 aa23.34■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.34■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 MAP2K2P36507 400 aa23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 GMLQ99445 158 aa23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.33■■□□□ 1.33
CTIF-206ENST00000588345 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 LBX1P52954 281 aa23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 ITGA6P23229 1130 aa23.31■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.31■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.31■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 USP17L3A6NCW0 530 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 USP17L4A6NCW7 530 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 GRM1Q13255 1194 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 FAM161AQ3B820 660 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 BEND3Q5T5X7 828 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 DLK2Q6UY11 383 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-206ENST00000588345 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.3■■□□□ 1.32
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