RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 RTL9Q8NET4 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
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TRAF4-216ENST00000586813 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 DOK7Q18PE1 504 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 PDE8AO60658 829 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.97■■□□□ 1.59
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TRAF4-216ENST00000586813 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 AOC2O75106 756 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 MAP2K2P36507 400 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-216ENST00000586813 TSPYL6Q8N831 410 aa24.96■■□□□ 1.59
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TRAF4-216ENST00000586813 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.94■■□□□ 1.58
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TRAF4-216ENST00000586813 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAF4-216ENST00000586813 G3V3G9 751 aa24.9■■□□□ 1.58
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TRAF4-216ENST00000586813 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAF4-216ENST00000586813 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAF4-216ENST00000586813 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.89■■□□□ 1.58
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TRAF4-216ENST00000586813 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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TRAF4-216ENST00000586813 GREM2Q9H772 168 aa24.84■■□□□ 1.57
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TRAF4-216ENST00000586813 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.8■■□□□ 1.56
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TRAF4-216ENST00000586813 H7C1W4 665 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 USP17L8P0C7I0 530 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 FLIIQ13045 1269 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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TRAF4-216ENST00000586813 A0A1B0GUL6 1792 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.79■■□□□ 1.56
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