RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578279.1

GPS1-206, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 5

Gene GPS1, Length 875 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-206ENST00000578279 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.65■■□□□ 1.22
GPS1-206ENST00000578279 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 FKBP1BP68106 108 aa22.64■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 NECTIN2Q92692 538 aa22.64■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 ZNF428Q96B54 188 aa22.64■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.63■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 GCC1Q96CN9 775 aa22.63■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 G3V3G9 751 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 TBC1D8O95759 1140 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 SCARF1Q14162 830 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 FAM89AQ96GI7 184 aa22.6■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.58■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.58■■□□□ 1.21
GPS1-206ENST00000578279 GPR25O00155 361 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 MOB2Q70IA6 237 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.56■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.56■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.56■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 UFL1O94874 794 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 TM4SF4P48230 202 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 SCN9AQ15858 1988 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 RIPK4P57078 832 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 GGA1Q9UJY5 639 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 USP17L8P0C7I0 530 aa22.53■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 ZNF609O15014 1411 aa22.53■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 COL4A1P02462 1669 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 FKTNO75072 461 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GPS1-206ENST00000578279 SREBF2Q12772 1141 aa22.51■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.51■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 GMLQ99445 158 aa22.51■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.5■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 NF2P35240 595 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 KRT24Q2M2I5 525 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 USP17L3A6NCW0 530 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 USP17L4A6NCW7 530 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 PODNQ7Z5L7 613 aa22.46■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.46■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
GPS1-206ENST00000578279 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 CHL1O00533 1208 aa22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 XDHP47989 1333 aa22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 OGFOD1Q8N543 542 aa22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ALDH1A1P00352 501 aa22.43■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ATP2B4P23634 1241 aa22.43■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 HYPKQ9NX55 129 aa22.43■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 TRIM17Q9Y577 477 aa22.43■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 POTEFA5A3E0 1075 aa22.42■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 HOXB7P09629 217 aa22.42■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 PRKG1Q13976 671 aa22.42■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 PSME4Q14997 1843 aa22.41■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 WNT10BO00744 389 aa22.41■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.41■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.41■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 SPRYD7Q5W111 196 aa22.4■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GPS1-206ENST00000578279 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GPS1-206ENST00000578279 PDE8AO60658 829 aa22.39■■□□□ 1.17
GPS1-206ENST00000578279 NEUROD2Q15784 382 aa22.39■■□□□ 1.17
GPS1-206ENST00000578279 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.39■■□□□ 1.17
GPS1-206ENST00000578279 FBXW7Q969H0 707 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms