RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMF1P82094 1093 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 VAC14Q08AM6 782 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 TXNRD1Q16881 649 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADAM32Q8TC27 787 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 COG3Q96JB2 828 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 RTL1A6NKG5 1358 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC8-202ENST00000577426 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ITGB4P16144 1822 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 FYB1O15117 783 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 GDF9O60383 454 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 HOXC9P31274 260 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERFEQ4G0M1 354 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 MEGF6O75095 1541 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNFRSF10AO00220 468 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SIAH2O43255 324 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBLN1P23142 703 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARID5BQ14865 1188 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDCA8Q53HL2 280 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CYP4X1Q8N118 509 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF592Q92610 1267 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 C5P01031 1676 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 NSD2O96028 1365 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 INSRP06213 1382 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIF24Q5T7B8 1368 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRAK2O60296 914 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 AMPHP49418 695 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR20EP86478 221 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR20CP86479 221 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR20DP86480 221 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR20BP86481 221 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR20AP86496 221 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEMA3FQ13275 785 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 GCC1Q96CN9 775 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 NCAPD2Q15021 1401 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 FLT4P35916 1363 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALDH1A1P00352 501 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOX11P35716 441 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF4Q96M43 638 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDK15Q96Q40 435 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 GFRA3O60609 400 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF827Q17R98 1081 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 RRAGCQ9HB90 399 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC8-202ENST00000577426 POM121CA8CG34 1229 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 J3QL48 77 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRM5P41594 1212 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALG2Q9H553 416 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms