RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575185.1

SPNS3-203, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 496 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-203ENST00000575185 RPS12P25398 132 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 GGA3Q9NZ52 723 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 EYA3Q99504 573 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 TRPA1O75762 1119 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 RNF186Q9NXI6 227 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC102AQ96A19 550 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 SLC10A3P09131 477 aa27■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 SOX10P56693 466 aa27■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 CDCA5Q96FF9 252 aa27■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 SULF1Q8IWU6 871 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 SPEF2Q9C093 1822 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 UFL1O94874 794 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 HOXB7P09629 217 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 CSRNP1Q96S65 589 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 RALBP1Q15311 655 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 HYPKQ9NX55 129 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-203ENST00000575185 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF609O15014 1411 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 G3V3G9 751 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 SCARF1Q14162 830 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 RUNDC1Q96C34 613 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 GGA1Q9UJY5 639 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MBIPQ9NS73 344 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MOB2Q70IA6 237 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MYD88Q99836 296 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 GOLGA2Q08379 1002 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 GMLQ99445 158 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS3-203ENST00000575185 MYH3P11055 1940 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 USP17L8P0C7I0 530 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 XDHP47989 1333 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 PDE8AO60658 829 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 FKBP1BP68106 108 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 MXD3Q9BW11 206 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 USP17L3A6NCW0 530 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 USP17L4A6NCW7 530 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF853P0CG23 659 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-203ENST00000575185 TBC1D8O95759 1140 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 ATP2B4P23634 1241 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 PODNQ7Z5L7 613 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 MED23Q9ULK4 1368 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 CTSWP56202 376 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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