RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 MPNDQ8N594 471 aa30.93■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.93■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.93■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 LRRC24Q50LG9 513 aa30.92■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 SIL1Q9H173 461 aa30.92■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.92■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 POLA2Q14181 598 aa30.91■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.91■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 CHRNDQ07001 517 aa30.9■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.9■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 SSH3Q8TE77 659 aa30.89■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 COPRSQ9NQ92 184 aa30.89■■■□□ 2.54
RBBP6-211ENST00000568316 EYA2O00167 538 aa30.88■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.88■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 XDHP47989 1333 aa30.88■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.88■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 LTBP1Q14766 1721 aa30.87■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.87■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 PSMD1Q99460 953 aa30.87■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.87■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 C6orf229H3BNL8 230 aa30.86■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 UFL1O94874 794 aa30.86■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.86■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.86■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 GGA1Q9UJY5 639 aa30.86■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 TAF5LO75529 589 aa30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 PRELPP51888 382 aa30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 METTL24Q5JXM2 366 aa30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 POLLQ9UGP5 575 aa30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.85■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 CIAO1O76071 339 aa30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 A0A1B0GUL6 1792 aa30.84■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 HMMRO75330 724 aa30.83■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.83■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 FBXO3Q9UK99 471 aa30.83■■■□□ 2.53
RBBP6-211ENST00000568316 SNAP23O00161 211 aa30.82■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 ATP2B4P23634 1241 aa30.82■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 LMNB1P20700 586 aa30.81■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 IL15P40933 162 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 KCNJ4P48050 445 aa30.81■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.8■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.8■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 SBF1O95248 1867 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 PPIP5K2O43314 1243 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 AAMPQ13685 434 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 AOC3Q16853 763 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 RNF181Q9P0P0 153 aa30.79■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 RIMBP2O15034 1052 aa30.78■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.78■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.78■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 WASHC4Q2M389 1173 aa30.77■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.77■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 EYA3Q99504 573 aa30.77■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 CEP126Q9P2H0 1117 aa30.77■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
RBBP6-211ENST00000568316 PDE8BO95263 885 aa30.76■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 KLRK1P26718 216 aa30.76■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 YY1P25490 414 aa30.75■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.75■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 TFCP2Q12800 502 aa30.74■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 COL4A5P29400 1685 aa30.74■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 MED23Q9ULK4 1368 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 SASH1O94885 1247 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 NEFLP07196 543 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 UBE4AQ14139 1066 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 VPS33BQ9H267 617 aa30.72■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 APBB1O00213 710 aa30.71■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 NIM1KQ8IY84 436 aa30.71■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 CHD4Q14839 1912 aa30.71■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 ATP2B3Q16720 1220 aa30.7■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 DOK7Q18PE1 504 aa30.7■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.7■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 JDP2Q8WYK2 163 aa30.7■■■□□ 2.51
RBBP6-211ENST00000568316 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
RBBP6-211ENST00000568316 FGFR2P21802 821 aa30.69■■■□□ 2.5
RBBP6-211ENST00000568316 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.1 ms